Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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C10orf55Q5SWW7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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C10orf55Q5SWW7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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C10orf55Q5SWW7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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C10orf55Q5SWW7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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C10orf55Q5SWW7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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C10orf55Q5SWW7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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C10orf55Q5SWW7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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C10orf55Q5SWW7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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