Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEXMIFQ5QGS0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms