Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A3Q5K4L6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms