Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCTE1Q5JU00 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCTE1Q5JU00 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms