Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms