Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 3,571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SVEP1Q4LDE5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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