Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms