Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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