Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms