Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXR2

C3orf36, Uncharacterized protein C3orf36, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf36Q3SXR2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf36Q3SXR2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms