Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C18orf21Q32NC0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C18orf21Q32NC0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms