Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms