Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MICAQ29983 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MICAQ29983 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MICAQ29983 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MICAQ29983 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms