Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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