Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms