Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME3Q16798 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME3Q16798 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME3Q16798 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME3Q16798 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME3Q16798 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME3Q16798 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME3Q16798 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME3Q16798 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME3Q16798 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME3Q16798 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME3Q16798 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME3Q16798 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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ME3Q16798 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME3Q16798 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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ME3Q16798 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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ME3Q16798 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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ME3Q16798 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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