Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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