Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CTF1Q16619 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CTF1Q16619 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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CTF1Q16619 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CTF1Q16619 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CTF1Q16619 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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