Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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SGCBQ16585 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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