Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms