Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms