Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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GRIK4Q16099 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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GRIK4Q16099 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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GRIK4Q16099 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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GRIK4Q16099 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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GRIK4Q16099 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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GRIK4Q16099 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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