Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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