Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA1Q15788 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms