Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SF1Q15637 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SF1Q15637 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SF1Q15637 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SF1Q15637 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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