Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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