Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
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