Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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