Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms