Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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