Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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