Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
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