Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms