Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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