Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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ATP1A4Q13733 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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ATP1A4Q13733 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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