Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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