Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA7Q13683 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms