Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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