Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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