Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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