Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RLFQ13129 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLFQ13129 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLFQ13129 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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