Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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GPS1Q13098 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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GPS1Q13098 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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