Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms