Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms