Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms