Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms