Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms