Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms