Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SOX4Q06945 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms