Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPB1Q06547 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms